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高通量篩選平臺助肽―人類白細胞抗原pHLA靶向藥物安全評估_abio生物試劑品牌網

abiopp6個月前 (06-13)技術49
高通量篩選平臺 ValidaTe 助力肽 - 人類白細胞抗原pHLA靶向藥物安全評估
--德國M2 點樣儀實現微腔芯片的高精準加樣

T 細胞受體(T-cell receptor, TCR)療法、雙特異性 T 細胞銜接器(bispecific T-cell engagers, BiTE)等基于肽 - 人類白細胞抗原(peptide-human leukocyte antigen, pHLA)的免疫治療手段,已逐步在癌癥領域展現出巨大潛力,精準評估藥物與 pHLA 的結合特異性成為臨床前安全評估的關鍵。然而,僅HLA-I類分子的免疫肽組約至少15 萬種 pHLA 復合物,傳統技術生物層干涉術(biolayer interferometry, BLI)、微陣列芯片SPR等,單次僅能最多檢測96種相互作用,通量低、耗時久,極大的脫靶險。因此,開發超高通量的篩選方法,對于確保 pHLA 靶向治療藥物的安全性和有效性,具有重要的臨床意義。

  2023 年 3 月,BioCopy 公司聯合 Immatics Biotechnologies公司在《Scientific Reports》發表題為《An ultra-high-throughput screen for the evaluation of peptide HLA-Binder interactions》的文章。在該研究中,構建了一種高通量篩選平臺ValidaTe,通過穩定化 pHLA 分子、聚二甲基硅氧烷(polydimethylsiloxan, PDMS)微腔芯片與單色反射干涉技術(highSCORE)的結合,實現對 TCR 與超 500 種 pHLA 復合物相互作用的大規模篩選分析。

實驗方法如下:
  1.肽庫制備與微腔芯片預處理
  • 合成制備 127 種多肽(含野生型及單氨基酸突變體),經高效液相色譜HPLC純化后溶于二甲基亞砜(DMSO)/ 水(5%/95%),濃度 200 μg/ml。
  • 微腔芯片(聚二甲基硅氧烷,PDMS 材質):使用M2-Automation 非接觸式皮升級/納升級點樣儀iOne,將 300 pl 肽溶液精準點樣至 5k-PDMS 芯片的 5226 個微腔中(單個微腔體積 500 pL,直徑 150 μm,間距 50 μm)。(圖1)
  • 干燥與存儲:室溫干燥后,芯片于 4℃保存,穩定期可達數月。
2.pHLA 復合物和肽-pHLA微腔芯片
  • pHLA 純化制備:表達含二硫鍵穩定化修飾的人類白細胞抗原 A02:01(human leukocyte antigen A02:01, HLA-A*02:01)重鏈與 β2 微球蛋白(β2-microglobulin, β2m),體外復性后經生物素化修飾(BirA 酶標記),終濃度 200 μg/ml。
  • 肽-pHLA-微腔芯片:通過M2-Automation 非接觸式皮升級/納升級點樣儀iOne,向含肽微腔中點樣 900 pl HLA 溶液。孵育后,pHLA 復合物通過生物素 - 鏈霉親和素(streptavidin, SA)相互作用,轉移至預活化的 3D 鏈霉親和素修飾玻璃片(highSCORE 芯片)。(圖1)
圖1肽-pHLA微腔芯片的實驗流程圖
(1)不同的多肽被點樣至微腔芯片的獨立微腔中,(2)多肽溶液干燥,(3)陣列可長期儲存(4)將生物素化的 HLA 分子點樣至各個微腔中發生復合物形成反應,(5)復合物通過生物素 - 鏈霉親和素相互作用轉移至鏈霉親和素(SA)修飾的基底上,(6)用于不同分析物的無標記分析,(7)結合曲線中確定動力學參數。
3.超高通量結合動力學檢測
  • 分析物制備:可溶性高親和力 TCR 分子梯度稀釋至 16-480 nM。
  • highSCORE 檢測:將肽-pHLA 微腔芯片置于高通量反射干涉儀中,依次進行基線校正(180 s)、結合(250-500 s)、解離(300-600 s)檢測,流速 2 μL/s,單次運行生成 5226 條結合曲線。
  • 數據擬合:采用 1:1 結合模型擬合動力學參數(結合速率常數kass、解離速率常數kdiss、平衡解離常數KD),6 次重復實驗累計獲得超 3 萬條有效曲線。
4.與傳統技術的對比驗證
  • BLI 對照實驗:使用 Octet RED384 系統,檢測相同 pHLA-TCR 相互作用,對比發現 ValidaTe 平臺數據集通量提升650 倍,且KD值相關性良好(R2>0.85),驗證了新技術的準確性。(圖2)
圖2 a) 從 highSCORE 和 BLI 測量獲得的KD值之間的相關性;BLI WTKD值顯示為藍色虛線,highSCORE WTKD表示為綠色虛線,箭頭突出顯示突出的點,灰色的點被排除在線性擬合之外。(b) highSCORE(綠色)和 BLI(藍色)測量的log10(KD)值的直方圖;BLI WTKD值顯示為藍色虛線,highSCORE WTKD表示為綠色虛線。
  研究結論:

1.技術突破:ValidaTe 平臺通過微腔芯片與自動化點樣技術(M2-Automation 非接觸式皮升級/納升級點樣儀iOne),解決了傳統微陣列中 pHLA 復合物穩定性差、材料消耗高的難題,單次實驗可處理超 500 種不同 pHLA 復合物,未來優化后有望突破 1000 種。

2.效率革命:相較于 BLI 的單次 96 通量得到的數據集,ValidaTe 實現650 倍提升,結合曲線生成速度從小時級縮短至分鐘級,大幅降低時間與材料成本(單 spot 材料消耗僅為傳統方法的 1/1000)。

3.應用價值成功解析 TCR 與 pHLA 的結合特異性,定位關鍵氨基酸位點,為藥物設計提供精準靶點,推動臨床前脫靶風險評估進入 “全譜篩查” 時代。

技術前景與展望

該平臺已實現商業化服務(BioCopy),可定制化篩選多種 HLA 亞型及治療性分子(如 TCR 抗體、BiTE),適用于制藥企業、科研機構的早期藥物開發。未來計劃拓展至細胞水平檢測與復合物穩定性分析,助力更多創新型免疫療法安全落地。

更多信息請參考原文: https://www.nature.com/articles/s41598-023-32384-z

M2-automation位于德國,專注于提供納升-皮升級超微量點樣生物芯片應用領域的解決方案及服務。自公司成立即以來,20年始終致力于開發高精度高靈活性生物樣品噴點液體處理平臺,
M2系列產品采用接觸式/非接觸式點樣技術,可輕松實現包括但不限于納米柱、微陣列、微針等各種標準化和個性化生物芯片制備,廣泛應用于微流控、生物傳感器、臨床快檢(POCT)等領域。

環亞生物,生命科學產品全國性代理商,具備完善的公司運營、產品管理、營銷、售前技術支持和售后維修體系。環亞生物作為M2-automation大中華區代理商,負責相關產品大中華區的營銷和售后支持。

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