PCR反應(yīng)控制涉及的主要方面總結(jié)_abio生物試劑品牌網(wǎng)
PCR反應(yīng)的控制涉及多個關(guān)鍵參數(shù)和步驟,以確保反應(yīng)的特異性、效率和產(chǎn)量。以下是PCR反應(yīng)控制的主要方面:
1. 反應(yīng)緩沖液
- pH值:提供適宜的酸堿度,通常為8.3。
- 離子濃度:如KCl和MgCl2,Mg2+的濃度對反應(yīng)特異性及產(chǎn)量影響顯著,通常為1.52mM。
- dNTPs:脫氧核苷三磷酸底物,終濃度為50400μM,且四種dNTP的濃度應(yīng)相同。
2. 酶
Taq DNA聚合酶:耐高溫,能在70℃下保持活性,但對過高溫度敏感。在每個循環(huán)的退火步驟中不需要重新添加。
3. 引物
設(shè)計原則:
- 長度:1530bp,常用20bp。
- G+C含量:4060%為宜。
- 避免5個以上嘌呤或嘧啶的連續(xù)排列。
- 避免引物內(nèi)部及引物間互補序列。
- 引物3’端應(yīng)與模板嚴格配對,特別是末尾的G和C。
4. 反應(yīng)溫度和時間
- 變性:95℃,通常30s,使雙鏈DNA解離。
- 退火:55℃左右,根據(jù)引物Tm值調(diào)整,一般低于Tm值5℃,時間12min。
- 延伸:72℃,時間取決于片段長度,約1min/kb。
5. 循環(huán)次數(shù)
一般為2535次,循環(huán)數(shù)過多會導(dǎo)致“平臺期”,產(chǎn)物量不再顯著增加。
6. 反應(yīng)體系
- 模板DNA:初始濃度影響循環(huán)數(shù),低濃度需增加循環(huán)數(shù)。
- 引物:濃度一般為0.10.5μM。
- Taq酶:通常24U/μl。
- MgCl2:與dNTPs濃度平衡,過高或過低都影響反應(yīng)。
7. 產(chǎn)物分析
8. 問題解決
- 產(chǎn)物量少:增加模板量、循環(huán)數(shù)、引物量,延長延伸時間。
- 產(chǎn)物多條帶:優(yōu)化退火溫度,減少循環(huán)數(shù),調(diào)整引物或酶量。
- 產(chǎn)物條帶不符:檢查引物、模板、污染。
9. 特殊條件
- 實時熒光定量PCR (qPCR):監(jiān)測反應(yīng)過程中產(chǎn)物的實時生成量。
- 數(shù)字PCR (dPCR):通過物理隔離實現(xiàn)高靈敏度和絕對定量。
10. 操作注意事項
通過精確控制這些參數(shù),可以實現(xiàn)高效、特異的PCR擴增,滿足不同實驗需求。
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