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文獻(xiàn)解讀:PM2.5暴露通過m6A甲基化調(diào)控雄性生殖功能損傷機(jī)制_abio生物試劑品牌網(wǎng)

abiopp5個(gè)月前 (08-07)技術(shù)65
近日,陸軍軍醫(yī)大學(xué)軍事預(yù)防醫(yī)學(xué)系王建康博士和張中豪博士為并列第一作者、劉晉?t教授為唯一通訊作者,在《Environmental Pollution》期刊上發(fā)表了題為“WTAP-mediated m6A modification of Hmgb2 contributes to spermatogenic damage induced by PM2.5 exposure”的研究論文。研究主要從m6A修飾角度揭示了PM2.5暴露對雄性生殖功能損傷的作用及其潛在機(jī)制。作者通過建立實(shí)時(shí)PM2.5暴露的小鼠模型和GC-2spd細(xì)胞系,發(fā)現(xiàn)PM2.5暴露會(huì)導(dǎo)致精子發(fā)生上皮損傷、精子運(yùn)動(dòng)能力下降,并且通過改變睪丸組織中m6A修飾圖譜,尤其是影響Hmgb2基因的m6A修飾,進(jìn)而影響精子發(fā)生相關(guān)基因的表達(dá),最終導(dǎo)致精子活力降低。該研究不僅為理解PM2.5對男性生殖健康的危害提供新視角,還為未來開發(fā)靶向環(huán)境污染導(dǎo)致生殖損傷的干預(yù)措施提供了理論依據(jù)。
 
標(biāo)題:WTAP-mediated m6A modification of Hmgb2 contributes to spermatogenic damage induced by PM2.5 exposure(WTAP介導(dǎo)的Hmgb2 m6A修飾促進(jìn)PM2.5暴露誘導(dǎo)的精子發(fā)生損傷)
發(fā)表時(shí)間:2025年4月1日
發(fā)表期刊:Environmental Pollution
影響因子:IF7.3/Q1
技術(shù)平臺(tái):MeRIP-seq、RNA-seq等(易基因金牌技術(shù))
作者單位:陸軍軍醫(yī)大學(xué)軍事預(yù)防醫(yī)學(xué)系王建康、張中豪、劉晉?t等
doi: 10.1016/j.envpol.2025.125896
 
N6-甲基腺苷(m6A)廣泛參與復(fù)雜的精子發(fā)生過程,同時(shí)對環(huán)境暴露極為敏感。眾多研究表明,細(xì)顆粒物(PM2.5)對男性生殖系統(tǒng)具有毒性,但其中涉及的具體表觀遺傳機(jī)制尚未得到充分研究。本研究通過構(gòu)建實(shí)時(shí)PM2.5暴露的小鼠模型和GC-2spd細(xì)胞系,研究了m6A修飾對PM2.5誘導(dǎo)的男性生殖功能障礙的影響。結(jié)果表明,PM2.5暴露導(dǎo)致小鼠精子發(fā)生上皮受損、精母細(xì)胞線粒體異常以及精子運(yùn)動(dòng)能力顯著下降。MeRIP-seq基因富集分析結(jié)果表明,與對照組相比,經(jīng)PM2.5處理的小鼠睪丸組織中差異m6A修飾基因在精子發(fā)生過程中顯著富集,且甲基轉(zhuǎn)移酶WTAP表達(dá)在PM2.5暴露后顯著降低。此外,PM2.5暴露導(dǎo)致精子發(fā)生相關(guān)基因Hmgb2表達(dá)以及Hmgb2 m6A修飾水平顯著降低。轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)及驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)表明,Hmgb2可能調(diào)控精母細(xì)胞中的ATP(腺苷三磷酸)水平。研究還證實(shí)m6A甲基轉(zhuǎn)移酶WTAP通過m6A修飾影響Hmgb2 mRNA穩(wěn)定性。本研究為理解PM2.5對精子發(fā)生損害以及精子運(yùn)動(dòng)能力降低提供了新見解。

  研究圖形摘要
研究方法
動(dòng)物實(shí)驗(yàn):8周齡實(shí)驗(yàn)小鼠隨機(jī)分為三組,分別暴露于高濃度環(huán)境顆粒物(CAP,483.6μg/m3)、正常環(huán)境未過濾空氣(UA,59.8μg/m3)和過濾空氣(FA,0.4μg/m3)中,每組8只小鼠。暴露結(jié)束后,對小鼠睪丸進(jìn)行組織學(xué)檢查、精子運(yùn)動(dòng)能力檢測、超微結(jié)構(gòu)觀察等。
細(xì)胞實(shí)驗(yàn):使用小鼠來源的精母細(xì)胞(GC-2spd體外細(xì)胞系)進(jìn)行細(xì)胞實(shí)驗(yàn),將 PM2.5標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)SRM1648a制備PM2.5股溶液(5mg/mL),選擇 0、25、50、100μg/mL 四個(gè)濃度的 PM2.5進(jìn)行細(xì)胞實(shí)驗(yàn)。
基因敲低與過表達(dá):分別對Wtap和Hmgb2進(jìn)行過表達(dá)和敲低操作。
轉(zhuǎn)錄組測序:對Hmgb2敲低的GC-2spd 細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq),分析RNA表達(dá)變化。
MeRIP-Seq對睪丸組織的m6A RNA免疫沉淀測序,檢測不同組暴露小鼠的m6A甲基化水平變化。
特定位點(diǎn)m6A修飾檢測(MeRIP - qRT - PCR):根據(jù) MeRIP-Seq結(jié)果設(shè)計(jì)特異性引物進(jìn)行 qRT - PCR 檢測特定位點(diǎn) m6A修飾水平。
 
結(jié)果圖形
(1)PM2.5暴露導(dǎo)致精子細(xì)胞損傷和精子運(yùn)動(dòng)能力下降
研究者構(gòu)建了實(shí)時(shí)PM2.5暴露的小鼠模型,通過組織學(xué)檢查發(fā)現(xiàn)PM2.5暴露導(dǎo)致小鼠精子發(fā)生上皮受損,表現(xiàn)為增加的空泡化和精子細(xì)胞排列紊亂(圖1A)。對VII期精子發(fā)生小管中的細(xì)胞計(jì)數(shù)顯示,PM2.5暴露后,粗線期精母細(xì)胞數(shù)量顯著減少,而精原細(xì)胞和圓形精子數(shù)量雖有下降趨勢,但差異未達(dá)到統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,支持細(xì)胞數(shù)量未發(fā)生顯著變化(圖1B-E)。超微結(jié)構(gòu)觀察顯示,PM2.5暴露后,精母細(xì)胞線粒體受損,表現(xiàn)為線粒體嵴減少和外膜破裂(圖1F),提示精母細(xì)胞是PM2.5暴露的關(guān)鍵靶細(xì)胞。此外,通過計(jì)算機(jī)輔助精子分析系統(tǒng)(CASA)分析小鼠精子運(yùn)動(dòng)能力,與過濾空氣(FA)組相比,正常環(huán)境(UA)組精子運(yùn)動(dòng)能力相關(guān)參數(shù)(總精子運(yùn)動(dòng)能力、超激活、PR和VSL)呈現(xiàn)下降趨勢,但差異未達(dá)到統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,而高濃度環(huán)境顆粒物(CAP)組所有參數(shù)均顯著下降(圖1G-J)。這些結(jié)果表明PM2.5暴露對小鼠精子發(fā)生和運(yùn)動(dòng)能力產(chǎn)生了明顯負(fù)作用。

 
圖1:PM2.5暴露導(dǎo)致小鼠精子發(fā)生上皮損傷和精子運(yùn)動(dòng)能力下降。
A 睪丸組織HE染色切片的代表性圖像。
(B-E) VII期精子發(fā)生小管中的精子細(xì)胞計(jì)數(shù),包括精原細(xì)胞(B)、粗線期精母細(xì)胞(C)、圓形精子(D)和Sertoli細(xì)胞(E)(n=8)。
(F)  睪丸超微結(jié)構(gòu)的代表性圖像。紅色箭頭線:受損的線粒體(嵴減少和外膜破裂)。
(G-J) 通過CASA測量的精子運(yùn)動(dòng)能力相關(guān)參數(shù),包括總精子運(yùn)動(dòng)能力(G)、前向運(yùn)動(dòng)能力(PR,H)、直線速度(VSL,I)和精子超活化(J)(n=8)。
 
(2)PM2.5暴露誘導(dǎo)睪丸m6A甲基化圖譜變化
為深入了解m6A修飾在PM2.5誘導(dǎo)的雄性生殖損傷中的作用,研究者對睪丸組織細(xì)胞中的RNA m6A進(jìn)行高通量測序(MeRIP-seq)。在FA組中,m6A修飾基因主要在精子發(fā)生、精子與透明帶結(jié)合以及精子細(xì)胞發(fā)育等過程中富集,表明m6A修飾在正常雄性生殖過程中發(fā)揮功能(圖2A)。進(jìn)一步分析差異甲基化區(qū)域(DMRs,P<0.05),結(jié)果表明與FA組相比,CAP組有152個(gè)顯著上調(diào)甲基化區(qū)域和105個(gè)顯著下調(diào)甲基化區(qū)域,而UA組與FA組之間有298個(gè)上調(diào)區(qū)域和85個(gè)下調(diào)區(qū)域(圖2B)。這些DMRs主要位于mRNA結(jié)構(gòu)的CDS和3'UTR區(qū)域(圖2C)。對DMRs的motif分析顯示,CAP組和FA組的DMRs主要出現(xiàn)在HGACC等motif中,而UA組和FA組的DMRs主要出現(xiàn)在HCGAH等motif中(圖2D)。對CAP、UA和FA組中差異m6A修飾基因的功能富集分析顯示,精子發(fā)生過程顯著富集(圖2E和F)。這些結(jié)果表明m6A修飾可能參與PM2.5誘導(dǎo)的雄性生殖損傷過程。MeRIP-Seq技術(shù)在這一部分發(fā)揮關(guān)鍵作用,其對RNA上的m6A修飾進(jìn)行高通量測序,從而全面揭示PM2.5暴露后睪丸組織中m6A修飾的整體變化情況,為后續(xù)尋找關(guān)鍵靶基因提供基礎(chǔ)。

  圖2:CAP、UA和FA組睪丸轉(zhuǎn)錄組范圍內(nèi)的差異m6A甲基化特征。
  (A) FA組中m6A修飾基因的基因本體(GO)富集分析。
(B) 差異m6A修飾peaks分析。
(C) 差異甲基化區(qū)域(DMRs)在mRNA上的分布模式。
(D) DMRs的motif分析。(R=A/G,H=A/C/U)
(E-F) CAP組與FA組(E)以及UA組與FA組(F)中不同m6A修飾基因的生物過程富集分析。
 
(3)Hmgb2是一個(gè)關(guān)鍵的差異表達(dá)m6A修飾精子發(fā)生相關(guān)基因
研究者進(jìn)一步分析了FA、UA和CAP組之間的差異m6A修飾精子發(fā)生相關(guān)基因的交集,共鑒定出10個(gè)潛在關(guān)鍵基因(Hmgb2、Tdrd5、Hspa1l、Bag6、Setx、Pax5、Map7、Dnm2、Chd5和PIwil1)。對這些基因在小鼠睪丸中的mRNA表達(dá)水平進(jìn)行驗(yàn)證分析,結(jié)果表明Hmgb2和Piwil1在PM2.5暴露小鼠睪丸中顯著下調(diào),而Tdrd5顯著上調(diào)(圖3A)。在GC-2spd細(xì)胞中存在類似結(jié)果(圖3B)。HMGB2蛋白在PM2.5暴露小鼠睪丸中的表達(dá)顯著降低(圖3C和D),但在體外模型中,HMGB2蛋白水平在PM2.5處理后也顯著下調(diào)(圖3E和F)。MeRIP-Seq結(jié)果顯示,PM2.5暴露后睪丸組織中Hmgb2的m6A修飾減少(圖3G),這一結(jié)果在體外模型中也得到進(jìn)一步驗(yàn)證(圖3H)。基于這些數(shù)據(jù),研究者將關(guān)注點(diǎn)聚焦于Hmgb2基因。MeRIP-Seq不僅能夠檢測到Hmgb2基因m6A修飾變化,還精確定位修飾發(fā)生的具體區(qū)域,為后續(xù)研究Hmgb2基因m6A修飾的功能提供重要依據(jù)。

  圖3:PM2.5暴露后GC-2spd細(xì)胞和睪丸中Hmgb2表達(dá)下調(diào)。
  (A-B) 小鼠睪丸(A)和GC-2spd細(xì)胞(B)中10個(gè)關(guān)鍵差異m6A修飾的精子發(fā)生相關(guān)基因mRNA表達(dá)(n=3)。
(C)  小鼠睪丸中HMGB2蛋白的表達(dá)。
(D)  小鼠睪丸中HMGB2蛋白水平的定量分析(n=3)。
(E)  GC-2spd細(xì)胞中HMGB2蛋白的表達(dá)。
(F)  細(xì)胞中HMGB2蛋白水平的定量分析(n=3)。
(G)  小鼠睪丸中Hmgb2 mRNA甲基化峰的可視化。
(H)通過MeRIP-qRT-PCR檢測PM2.5暴露對GC-2spd細(xì)胞中Hmgb2 m6A修飾的作用(n=3)。
 
(4)Hmgb2下調(diào)介導(dǎo)小鼠精子發(fā)生細(xì)胞中的ATP水平變化
Hmgb2在精子發(fā)生和精子運(yùn)動(dòng)能力中的具體功能尚不清楚。研究者構(gòu)建了Hmgb2敲低的GC-2spd細(xì)胞系并進(jìn)行RNA-seq轉(zhuǎn)錄組測序,共鑒定出199個(gè)差異表達(dá)基因(DEGs),包括145個(gè)上調(diào)基因和54個(gè)下調(diào)基因(圖4C)。對這些DEGs進(jìn)行通路富集分析發(fā)現(xiàn),氧化磷酸化通路顯著富集,GO富集分析顯示線粒體呼吸鏈復(fù)合體I顯著富集(圖4D和E)。這些結(jié)果表明Hmgb2可能參與精子發(fā)生細(xì)胞中的ATP合成。ATP水解是真核細(xì)胞中代謝能量的主要來源,ATP檢測試驗(yàn)顯示Hmgb2敲低后細(xì)胞內(nèi)ATP水平降低(圖4F)。進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,PM2.5暴露的GC-2spd細(xì)胞中ATP水平降低(圖4G)。通過qRT-PCR驗(yàn)證轉(zhuǎn)錄組富集的氧化磷酸化基因在Hmgb2敲低和PM2.5處理的GC-2spd細(xì)胞中的表達(dá)確實(shí)受到干擾。研究者驗(yàn)證了PM2.5誘導(dǎo)的ATP降低可以通過過表達(dá)Hmgb2來逆轉(zhuǎn)(圖4H和I)。這些數(shù)據(jù)表明Hmgb2可能調(diào)控精子發(fā)生細(xì)胞中的ATP水平,從而影響精子運(yùn)動(dòng)能力。

  圖4:Hmgb2調(diào)控GC-2spd細(xì)胞中的ATP水平。
  (A-B) 對照組和轉(zhuǎn)染siHMGB2的細(xì)胞中HMGB2蛋白的表達(dá)及定量分析(n=3)。
(C)  GC-2spd細(xì)胞轉(zhuǎn)染siHMGB2后轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果的火山圖。
(D)  RNA-seq中差異表達(dá)基因的KEGG分析圖。
(E)  RNA-seq的GO富集分析結(jié)果。
(F)  siHMGB2處理后GC-2spd細(xì)胞中的ATP水平。
(G)  PM2.5暴露后細(xì)胞中的ATP水平。
(H)  HMGB2-OE質(zhì)粒處理后的HMGB2蛋白表達(dá)。
(I)   有無PM2.5處理時(shí),HMGB2-OE質(zhì)粒處理后GC-2spd細(xì)胞中的ATP水平。
 
(5)PM2.5誘導(dǎo)的m6A修飾可能主要由m6A甲基轉(zhuǎn)移酶WTAP下調(diào)引起
差異m6A修飾受m6A甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基轉(zhuǎn)移酶調(diào)控。為探索PM2.5暴露小鼠雄性生殖系統(tǒng)中m6A甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基轉(zhuǎn)移酶是否差異表達(dá),研究者檢測了甲基轉(zhuǎn)移酶(METTL3、METTL4和WTAP)和去甲基轉(zhuǎn)移酶(FTO和ALKBH5)的mRNA表達(dá)。結(jié)果表明,PM2.5暴露小鼠睪丸中m6A甲基轉(zhuǎn)移酶WTAP表達(dá)顯著降低,而PM2.5對m6A去甲基轉(zhuǎn)移酶mRNA表達(dá)無影響(圖5A)。在PM2.5暴露的GC-2spd細(xì)胞中也得到一致結(jié)果(圖5B)。此外,WTAP蛋白在PM2.5暴露的睪丸組織和GC-2spd細(xì)胞中的表達(dá)顯著降低(圖5C-F)。同時(shí),WTAP蛋白與Hmgb2 mRNA之間存在很高的互作概率。

  圖5:PM2.5暴露后GC-2spd細(xì)胞和睪丸中m6A甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基轉(zhuǎn)移酶的表達(dá)檢測。
  (A-B) 小鼠睪丸(A)和GC-2spd細(xì)胞(B)中甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基轉(zhuǎn)移酶的mRNA表達(dá)(n=3)。
(C)  小鼠睪丸中WTAP蛋白的表達(dá)。
(D)  小鼠睪丸中WTAP蛋白的定量分析(n=3)。
(E)  GC-2spd細(xì)胞中WTAP蛋白的表達(dá)。
(F)  GC-2spd細(xì)胞中WTAP蛋白的定量分析(n=3)。
 
(6)WTAP通過m6A修飾調(diào)控PM2.5誘導(dǎo)的Hmgb2表達(dá)降低
接下來,研究者進(jìn)一步確認(rèn)Hmgb2表達(dá)是否受甲基轉(zhuǎn)移酶WTAP的調(diào)控。首先通過RNA免疫沉淀實(shí)驗(yàn)(RIP)結(jié)果表明,與陰性對照IgG相比,抗WTAP抗體在Hmgb2中顯著富集(圖6A),表明WTAP蛋白與Hmgb2 mRNA之間存在互作。使用siRNA敲低Wtap后,GC-2spd細(xì)胞中Hmgb2 mRNA表達(dá)顯著降低,蛋白表達(dá)驗(yàn)證結(jié)果也一致(圖6B-D)。為研究m6A修飾的具體調(diào)控作用,研究者進(jìn)行MeRIP-qRT-PCR實(shí)驗(yàn)。根據(jù)MeRIP-Seq結(jié)果設(shè)計(jì)特異性引物,發(fā)現(xiàn)敲低Wtap導(dǎo)致Hmgb2的m6A修飾水平降低(圖6E)。進(jìn)一步構(gòu)建過表達(dá)Wtap的細(xì)胞系,結(jié)果顯示過表達(dá)Wtap后GC-2spd細(xì)胞中Hmgb2的m6A修飾顯著提高(圖6F)。研究者還證明PM2.5誘導(dǎo)的Hmgb2降低可以通過過表達(dá)Wtap來逆轉(zhuǎn)(圖6G和H)。為驗(yàn)證Wtap是否通過m6A修飾調(diào)控Hmgb2 mRNA穩(wěn)定性,研究者進(jìn)行RNA穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)。結(jié)果表明敲低Wtap加速Hmgb2 mRNA降解(圖6I)。總體而言,這些結(jié)果表明PM2.5誘導(dǎo)的Hmgb2低表達(dá)是由于WTAP通過m6A修飾調(diào)控的Hmgb2 mRNA穩(wěn)定性降低所致。

  圖6:WTAP通過m6A修飾調(diào)控Hmgb2 mRNA的穩(wěn)定性。
  (A) 通過RNA免疫沉淀(RIP)分析WTAP蛋白與Hmgb2 mRNA的互作(n=3)。
(B) 轉(zhuǎn)染siWTAP后GC-2spd細(xì)胞中Wtap和Hmgb2 mRNA表達(dá)的驗(yàn)證(n=3)。
(C) siWTAP處理后細(xì)胞中WTAP和HMGB2蛋白的表達(dá)。
(D) siWTAP處理后WTAP和HMGB2蛋白表達(dá)的定量分析(n=3)。
(E) siWTAP-3處理對GC-2spd細(xì)胞中Hmgb2的m6A修飾的影響(n=3)。
(F) Wtap過表達(dá)后GC-2spd細(xì)胞中Hmgb2的m6A修飾水平(n=3)。
(G) 有無PM2.5處理時(shí),對照組和WTAP-OEGC-2spd細(xì)胞中WTAP和HMGB2蛋白的表達(dá)水平。
(H) WTAP和HMGB2蛋白的定量分析(n=3)。
(I) 與siNC組相比,有無siWTAP處理時(shí)GC-2spd細(xì)胞中Hmgb2 mRNA的穩(wěn)定性(n=3)。
 
結(jié)論和啟示
本研究從m6A修飾的表觀遺傳學(xué)角度為理解PM2.5的雄性生殖毒性提供了新的視角。PM2.5暴露后,m6A甲基轉(zhuǎn)移酶WTAP表達(dá)降低,導(dǎo)致Hmgb2 mRNA穩(wěn)定性降低(通過降低Hmgb2的m6A修飾),進(jìn)而影響精子發(fā)生細(xì)胞中的ATP水平,最終導(dǎo)致精子運(yùn)動(dòng)能力下降。本研究揭示了PM2.5暴露導(dǎo)致小鼠精子發(fā)生上皮受損和精子運(yùn)動(dòng)能力下降的現(xiàn)象,并闡明了m6A修飾在PM2.5暴露導(dǎo)致的精子發(fā)生細(xì)胞損傷中的作用。

MeRIP-Seq在本研究中的作用
本研究通過MeRIP-Seq技術(shù)全面揭示了PM2.5暴露對睪丸組織m6A修飾的影響,并進(jìn)一步通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了關(guān)鍵基因Hmgb2的m6A修飾變化及其功能。這一發(fā)現(xiàn)提示,在未來類似的污染環(huán)境暴露研究中,m6A修飾檢測技術(shù)(如MeRIP-Seq)可以作為一種強(qiáng)有力的工具,用于探索環(huán)境因素對生物體基因表達(dá)和生理功能的影響機(jī)制,為開發(fā)靶向干預(yù)措施提供理論依據(jù)。
 
參考文獻(xiàn):
Wang J, Zhang Z, Shi F, Li Y, Shi C, Wang T, Sun L, Ao L, Han F, Chen Q, Cao J, Liu J. WTAP-mediated m6A modification of Hmgb2 contributes to spermatogenic damage induced by PM2.5 exposure. Environ Pollut. 2025 Feb 21:125896. doi: 10.1016/j.envpol.2025.125896.

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近日,浙江大學(xué)劉帥課題組使用 納微儀器Nanowetech的NWDPS快速納米藥物制備系統(tǒng)制備單組分陽離子脂質(zhì)mRNA,靜脈給藥后靶向脾臟T細(xì)胞。   NWDPS快速納米藥...

小鼠原代小腸類器官培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)步驟及應(yīng)用指南_abio生物試劑品牌網(wǎng)

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應(yīng)用指南 | 小鼠原代小腸類器官培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)   #應(yīng)用指南# 2009 年,Hans Clevers 及其團(tuán)隊(duì)利用 Lgr5+ 腸干細(xì)胞在體外培養(yǎng)出了三維小腸類器官結(jié)構(gòu)。這種結(jié)...

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